Este es el paso final del proceso de ratificación del acuerdo, mediante el cual la UE y Centroamérica se comprometen a una relación estrecha y de largo plazo en todas las áreas políticas principales . Permitirá la plena implementación del acuerdo el primer día del mes siguiente a la notificación de la UE a sus homólogos centroamericanos. La plena entrada en vigor dará un importante impulso a las relaciones birregionales. 

El acuerdo tiene como objetivo fortalecer y consolidar las relaciones entre las partes a través de una asociación basada en tres partes fundamentales que se refuerzan mutuamente: el diálogo político , la cooperación y el comercio . Además,:

• Desarrollar una asociación política privilegiada basada en valores, principios y objetivos comunes, en particular el respeto y la promoción de la democracia y los derechos humanos, el desarrollo sostenible, la buena gobernanza y el Estado de derecho.
• mejorar la cooperación birregional entre la UE y Centroamérica en todos los ámbitos de interés común
• Ampliar y diversificar la relación comercial birregional de las partes de conformidad con el acuerdo de la Organización Mundial del Comercio ( OMC ) y este acuerdo.
• Fortalecer y profundizar la integración regional en áreas de interés común.
• Reforzar las relaciones de buena vecindad y el principio de resolución pacífica de disputas.
• Mantener y desarrollar el nivel de buena gobernanza y estándares sociales, laborales y ambientales.
• Fomentar un mayor comercio e inversión entre las partes. 

Mientras tanto, el pilar comercial del acuerdo de asociación ha jugado un papel importante en la promoción del comercio y la inversión entre Europa y Centroamérica. Se aplica provisionalmente desde el 1 de agosto de 2013 con Honduras, Nicaragua y Panamá, desde el 1 de octubre de 2013 con Costa Rica y El Salvador, y desde el 1 de diciembre de 2013 con Guatemala. 

Esto ha hecho que sea más fácil y barato comercializar productos hacia y desde Centroamérica, como resultado el comercio bilateral ha aumentado significativamente, ha eliminado la mayoría de los aranceles de importación y ha mejorado el acceso a los mercados de adquisiciones e inversiones gubernamentales . Crea un entorno más predecible para el comercio en Centroamérica, con un mecanismo de mediación para barreras no arancelarias y un mecanismo bilateral de solución de disputas. Además, la interacción con la sociedad civil en el marco del capítulo sobre comercio y desarrollo sostenible ha resultado fructífera para resaltar los beneficios más amplios del acuerdo.

Además, el acuerdo también proporcionará un marco propicio reforzado para la implementación de la estrategia de inversión Global Gateway de la UE , apoyando la infraestructura y mejorando la conectividad global y regional en los sectores digital, climático, transporte, salud, energía y educación.

El 29 de junio de 2012 la UE y los estados centroamericanos (Costa Rica, El Salvador, Guatemala, Honduras, Nicaragua y Panamá), firmaron el acuerdo en Tegucigalpa, Honduras. El Parlamento Europeo dio su aprobación el 11 de diciembre de 2012 y el 17 de enero de 2024 finalizaron los procedimientos de ratificación del acuerdo de asociación por parte de los Estados miembros.